Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
SCAF11Q99590 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.08■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
SCAF11Q99590 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SCAF11Q99590 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
SCAF11Q99590 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.92■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SCAF11Q99590 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SCAF11Q99590 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SCAF11Q99590 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SCAF11Q99590 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SCAF11Q99590 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
SCAF11Q99590 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms