Protein–RNA interactions for Protein: Q99467

CD180, CD180 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD180Q99467 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CD180Q99467 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CD180Q99467 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CD180Q99467 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD180Q99467 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CD180Q99467 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CD180Q99467 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD180Q99467 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD180Q99467 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD180Q99467 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CD180Q99467 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CD180Q99467 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CD180Q99467 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CD180Q99467 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD180Q99467 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD180Q99467 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD180Q99467 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD180Q99467 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CD180Q99467 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD180Q99467 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD180Q99467 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD180Q99467 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD180Q99467 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD180Q99467 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD180Q99467 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD180Q99467 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD180Q99467 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CD180Q99467 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD180Q99467 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD180Q99467 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD180Q99467 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD180Q99467 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD180Q99467 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD180Q99467 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD180Q99467 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD180Q99467 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD180Q99467 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD180Q99467 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD180Q99467 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD180Q99467 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD180Q99467 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD180Q99467 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD180Q99467 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD180Q99467 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD180Q99467 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD180Q99467 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD180Q99467 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD180Q99467 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD180Q99467 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD180Q99467 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD180Q99467 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD180Q99467 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CD180Q99467 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CD180Q99467 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CD180Q99467 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CD180Q99467 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CD180Q99467 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD180Q99467 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD180Q99467 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD180Q99467 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CD180Q99467 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CD180Q99467 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD180Q99467 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD180Q99467 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD180Q99467 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD180Q99467 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CD180Q99467 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CD180Q99467 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CD180Q99467 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD180Q99467 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CD180Q99467 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CD180Q99467 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CD180Q99467 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CD180Q99467 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms