Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMB7Q99436 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PSMB7Q99436 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PSMB7Q99436 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PSMB7Q99436 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMB7Q99436 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMB7Q99436 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMB7Q99436 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms