Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ6

FERD3L, Fer3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FERD3LQ96RJ6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERD3LQ96RJ6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERD3LQ96RJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERD3LQ96RJ6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FERD3LQ96RJ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FERD3LQ96RJ6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FERD3LQ96RJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FERD3LQ96RJ6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FERD3LQ96RJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FERD3LQ96RJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FERD3LQ96RJ6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FERD3LQ96RJ6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FERD3LQ96RJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FERD3LQ96RJ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms