Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGB3A2Q96PL1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGB3A2Q96PL1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCGB3A2Q96PL1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGB3A2Q96PL1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SCGB3A2Q96PL1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SCGB3A2Q96PL1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms