Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CMTM3Q96MX0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CMTM3Q96MX0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CMTM3Q96MX0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMTM3Q96MX0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMTM3Q96MX0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CMTM3Q96MX0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms