Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
JSRP1Q96MG2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JSRP1Q96MG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
JSRP1Q96MG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JSRP1Q96MG2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
JSRP1Q96MG2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
JSRP1Q96MG2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms