Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
RNPC3Q96LT9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RNPC3Q96LT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RNPC3Q96LT9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RNPC3Q96LT9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RNPC3Q96LT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RNPC3Q96LT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RNPC3Q96LT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RNPC3Q96LT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms