Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
PHACTR3Q96KR7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
PHACTR3Q96KR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PHACTR3Q96KR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PHACTR3Q96KR7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PHACTR3Q96KR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PHACTR3Q96KR7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PHACTR3Q96KR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms