Protein–RNA interactions for Protein: Q96K37

SLC35E1, Solute carrier family 35 member E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E1Q96K37 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC35E1Q96K37 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC35E1Q96K37 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC35E1Q96K37 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SLC35E1Q96K37 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC35E1Q96K37 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC35E1Q96K37 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms