Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DCHS1Q96JQ0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DCHS1Q96JQ0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
DCHS1Q96JQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DCHS1Q96JQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DCHS1Q96JQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DCHS1Q96JQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DCHS1Q96JQ0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms