Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEC22AQ96IW7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC22AQ96IW7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC22AQ96IW7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEC22AQ96IW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEC22AQ96IW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SEC22AQ96IW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms