Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SUCLG2Q96I99 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SUCLG2Q96I99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SUCLG2Q96I99 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SUCLG2Q96I99 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SUCLG2Q96I99 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SUCLG2Q96I99 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
SUCLG2Q96I99 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms