Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM41AQ96HV5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM41AQ96HV5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMEM41AQ96HV5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM41AQ96HV5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM41AQ96HV5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMEM41AQ96HV5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms