Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SH3YL1Q96HL8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SH3YL1Q96HL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SH3YL1Q96HL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SH3YL1Q96HL8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SH3YL1Q96HL8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SH3YL1Q96HL8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SH3YL1Q96HL8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms