Protein–RNA interactions for Protein: Q96GQ7

DDX27, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX27Q96GQ7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DDX27Q96GQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DDX27Q96GQ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
DDX27Q96GQ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
DDX27Q96GQ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDX27Q96GQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DDX27Q96GQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDX27Q96GQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDX27Q96GQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms