Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC35A4Q96G79 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC35A4Q96G79 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC35A4Q96G79 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC35A4Q96G79 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC35A4Q96G79 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC35A4Q96G79 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms