Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ5

CMTM7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM7Q96FZ5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CMTM7Q96FZ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CMTM7Q96FZ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CMTM7Q96FZ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CMTM7Q96FZ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CMTM7Q96FZ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CMTM7Q96FZ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms