Protein–RNA interactions for Protein: Q96FL8

SLC47A1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A1Q96FL8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC47A1Q96FL8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC47A1Q96FL8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC47A1Q96FL8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC47A1Q96FL8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC47A1Q96FL8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC47A1Q96FL8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC47A1Q96FL8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC47A1Q96FL8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC47A1Q96FL8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC47A1Q96FL8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms