Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NEIL1Q96FI4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEIL1Q96FI4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEIL1Q96FI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEIL1Q96FI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEIL1Q96FI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEIL1Q96FI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms