Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SIRT1Q96EB6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SIRT1Q96EB6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SIRT1Q96EB6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
SIRT1Q96EB6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SIRT1Q96EB6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
SIRT1Q96EB6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
SIRT1Q96EB6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
SIRT1Q96EB6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
SIRT1Q96EB6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
SIRT1Q96EB6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms