Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCTD12Q96CX2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KCTD12Q96CX2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCTD12Q96CX2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD12Q96CX2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD12Q96CX2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCTD12Q96CX2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCTD12Q96CX2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms