Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBGCP3Q96CW5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBGCP3Q96CW5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TUBGCP3Q96CW5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TUBGCP3Q96CW5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TUBGCP3Q96CW5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TUBGCP3Q96CW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms