Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ULK4Q96C45 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ULK4Q96C45 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ULK4Q96C45 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ULK4Q96C45 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ULK4Q96C45 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ULK4Q96C45 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ULK4Q96C45 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms