Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLAMF9Q96A28 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLAMF9Q96A28 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLAMF9Q96A28 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLAMF9Q96A28 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLAMF9Q96A28 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLAMF9Q96A28 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms