Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TOP1MTQ969P6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TOP1MTQ969P6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOP1MTQ969P6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TOP1MTQ969P6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TOP1MTQ969P6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TOP1MTQ969P6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TOP1MTQ969P6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms