Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ATP2A3Q93084 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP2A3Q93084 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ATP2A3Q93084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A3Q93084 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A3Q93084 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A3Q93084 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms