Protein–RNA interactions for Protein: Q93062

RBPMS, RNA-binding protein with multiple splicing, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBPMSQ93062 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RBPMSQ93062 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBPMSQ93062 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RBPMSQ93062 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBPMSQ93062 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RBPMSQ93062 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBPMSQ93062 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms