Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA8

HTR3C, 5-hydroxytryptamine receptor 3C, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3CQ8WXA8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HTR3CQ8WXA8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HTR3CQ8WXA8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
HTR3CQ8WXA8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTR3CQ8WXA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HTR3CQ8WXA8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HTR3CQ8WXA8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR3CQ8WXA8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR3CQ8WXA8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HTR3CQ8WXA8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HTR3CQ8WXA8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms