Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ4

ABCA10, ATP-binding cassette sub-family A member 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA10Q8WWZ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
ABCA10Q8WWZ4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.36■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.32■■■■■ 4.85
ABCA10Q8WWZ4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
ABCA10Q8WWZ4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
ABCA10Q8WWZ4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCA10Q8WWZ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCA10Q8WWZ4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCA10Q8WWZ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA10Q8WWZ4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
ABCA10Q8WWZ4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.77
ABCA10Q8WWZ4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.81■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCA10Q8WWZ4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms