Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RNF138Q8WVD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RNF138Q8WVD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RNF138Q8WVD3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF138Q8WVD3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF138Q8WVD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF138Q8WVD3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms