Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV41

SNX33, Sorting nexin-33, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX33Q8WV41 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX33Q8WV41 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX33Q8WV41 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX33Q8WV41 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX33Q8WV41 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SNX33Q8WV41 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SNX33Q8WV41 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNX33Q8WV41 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms