Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU2

SSC4D, Scavenger receptor cysteine-rich domain-containing group B protein, humanhuman

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Length 575 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC4DQ8WTU2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSC4DQ8WTU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSC4DQ8WTU2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSC4DQ8WTU2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSC4DQ8WTU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSC4DQ8WTU2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSC4DQ8WTU2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SSC4DQ8WTU2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
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