Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDI1Q8WTU0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDI1Q8WTU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDI1Q8WTU0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDI1Q8WTU0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDI1Q8WTU0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDI1Q8WTU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms