Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA2Q8TDQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GNPDA2Q8TDQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GNPDA2Q8TDQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GNPDA2Q8TDQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GNPDA2Q8TDQ7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GNPDA2Q8TDQ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms