Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms