Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PATJQ8NI35 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PATJQ8NI35 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PATJQ8NI35 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PATJQ8NI35 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PATJQ8NI35 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PATJQ8NI35 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms