Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHQ1

CEP70, Centrosomal protein of 70 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP70Q8NHQ1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP70Q8NHQ1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP70Q8NHQ1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CEP70Q8NHQ1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CEP70Q8NHQ1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CEP70Q8NHQ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CEP70Q8NHQ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CEP70Q8NHQ1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CEP70Q8NHQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP70Q8NHQ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms