Protein–RNA interactions for Protein: Q8NGD0

OR4M1, Olfactory receptor 4M1, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OR4M1Q8NGD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
OR4M1Q8NGD0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
OR4M1Q8NGD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
OR4M1Q8NGD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
OR4M1Q8NGD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
OR4M1Q8NGD0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OR4M1Q8NGD0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OR4M1Q8NGD0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OR4M1Q8NGD0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OR4M1Q8NGD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR4M1Q8NGD0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OR4M1Q8NGD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms