Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NLGN4YQ8NFZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NLGN4YQ8NFZ3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NLGN4YQ8NFZ3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLGN4YQ8NFZ3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLGN4YQ8NFZ3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLGN4YQ8NFZ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NLGN4YQ8NFZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms