Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE28

STKLD1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, humanhuman

Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STKLD1Q8NE28 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
STKLD1Q8NE28 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
STKLD1Q8NE28 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
STKLD1Q8NE28 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
STKLD1Q8NE28 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
STKLD1Q8NE28 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
STKLD1Q8NE28 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms