Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CARMIL3Q8ND23 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CARMIL3Q8ND23 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CARMIL3Q8ND23 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CARMIL3Q8ND23 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.81■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CARMIL3Q8ND23 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CARMIL3Q8ND23 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CARMIL3Q8ND23 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CARMIL3Q8ND23 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CARMIL3Q8ND23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CARMIL3Q8ND23 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms