Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM1BQ8NB78 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDM1BQ8NB78 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDM1BQ8NB78 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
KDM1BQ8NB78 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM1BQ8NB78 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KDM1BQ8NB78 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDM1BQ8NB78 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms