Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9R8

SCAI, Protein SCAI, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAIQ8N9R8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCAIQ8N9R8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCAIQ8N9R8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCAIQ8N9R8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCAIQ8N9R8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCAIQ8N9R8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCAIQ8N9R8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SCAIQ8N9R8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms