Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
GPC2Q8N158 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
GPC2Q8N158 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
GPC2Q8N158 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
GPC2Q8N158 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GPC2Q8N158 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
GPC2Q8N158 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GPC2Q8N158 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GPC2Q8N158 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GPC2Q8N158 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GPC2Q8N158 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms