Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.144e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-209ENST00000596437 894 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-222ENST00000600935 587 ntTSL 413.96□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.24e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.224e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 213.57□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.244e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-205ENST00000401672 2199 ntTSL 212.9□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-218ENST00000599788 564 ntTSL 412.64□□□□□ -0.394e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 RNA5-8SP6-201ENST00000515896 152 ntBASIC12.56□□□□□ -0.43e-11■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.454e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CAMSAP1-202ENST00000389532 7696 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-217ENST00000599567 579 ntTSL 412.15□□□□□ -0.464e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 AC011452.1-201ENST00000451973 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.524e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CDK16-204ENST00000457458 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.544e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 IL4I1-205ENST00000596011 714 ntTSL 211.53□□□□□ -0.564e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-213ENST00000597814 510 ntTSL 411.49□□□□□ -0.574e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-206ENST00000539409 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.584e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 CAMSAP1-201ENST00000312405 6054 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.594e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.64e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-203ENST00000593652 905 ntTSL 211□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-205ENST00000588719 484 ntTSL 310.86□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.694e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-213ENST00000609145 570 ntTSL 210.69□□□□□ -0.74e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.774e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.784e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-202ENST00000422090 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.814e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NDST2-202ENST00000309979 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.854e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.894e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PEPD-208ENST00000590731 557 ntTSL 49.34□□□□□ -0.914e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 RNA5-8SP2-201ENST00000363564 152 ntBASIC9.22□□□□□ -0.934e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 NUP62-210ENST00000596680 473 ntTSL 28.98□□□□□ -0.974e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.144e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 FAM60A-205ENST00000539004 459 ntTSL 56.08□□□□□ -1.444e-6■■■■■ 40.8
PHF6Q8IWS0 KLHL24-203ENST00000437402 563 ntTSL 525.06■■□□□ 1.67e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-204ENST00000454495 603 ntTSL 323.42■■□□□ 1.347e-8■■■■■ 40.7
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PHF6Q8IWS0 KLHL24-212ENST00000481126 389 ntTSL 223.32■■□□□ 1.327e-8■■■■■ 40.7
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PHF6Q8IWS0 KLHL24-202ENST00000427201 562 ntTSL 421.65■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-209ENST00000473045 542 ntTSL 421.34■■□□□ 1.017e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-208ENST00000468101 574 ntTSL 420.82■□□□□ 0.927e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-210ENST00000475827 545 ntTSL 417.65■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.197e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 KLHL24-205ENST00000454652 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.767e-8■■■■■ 40.7
PHF6Q8IWS0 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 NCOR2-215ENST00000458234 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)13.2□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 40.6
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PHF6Q8IWS0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 TPM4-206ENST00000587201 877 ntTSL 220.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 40.6
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PHF6Q8IWS0 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 TPM4-210ENST00000588507 367 ntTSL 310.2□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 40.6
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-207ENST00000435198 1056 ntTSL 330.74■■■□□ 2.512e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 229.63■■■□□ 2.339e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 E4F1-202ENST00000562589 817 ntTSL 527.74■■■□□ 2.039e-7■■■■■ 40.4
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PHF6Q8IWS0 UBE2J2-210ENST00000464036 1256 ntTSL 325.96■■□□□ 1.752e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.669e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-206ENST00000422076 643 ntTSL 525.29■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-219ENST00000503294 814 ntTSL 425.29■■□□□ 1.642e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.572e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.449e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 E4F1-207ENST00000565413 940 ntTSL 323.32■■□□□ 1.329e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-214ENST00000473215 1028 ntTSL 323.09■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-209ENST00000461142 837 ntTSL 323.08■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 ZYX-205ENST00000446634 926 ntTSL 522.16■■□□□ 1.149e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-211ENST00000466752 886 ntTSL 321.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-217ENST00000491779 611 ntTSL 221.79■■□□□ 1.082e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 ZYX-204ENST00000436448 632 ntTSL 420.96■□□□□ 0.959e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-216ENST00000488418 750 ntTSL 220.91■□□□□ 0.942e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-208ENST00000450390 2455 ntTSL 520.83■□□□□ 0.932e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-220ENST00000509720 472 ntTSL 320.75■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 220.46■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 EEF1D-221ENST00000528382 308 ntTSL 520.14■□□□□ 0.819e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.769e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 40.4
PHF6Q8IWS0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 40.4
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