Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDKL3Q8IVW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDKL3Q8IVW4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDKL3Q8IVW4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDKL3Q8IVW4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDKL3Q8IVW4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDKL3Q8IVW4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms