Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUR0

TRAPPC5, Trafficking protein particle complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC5Q8IUR0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAPPC5Q8IUR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC5Q8IUR0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC5Q8IUR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAPPC5Q8IUR0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAPPC5Q8IUR0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAPPC5Q8IUR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRAPPC5Q8IUR0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms