Protein–RNA interactions for Protein: Q86X55

CARM1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARM1Q86X55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARM1Q86X55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CARM1Q86X55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARM1Q86X55 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARM1Q86X55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CARM1Q86X55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CARM1Q86X55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CARM1Q86X55 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms