Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LCA5Q86VQ0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LCA5Q86VQ0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LCA5Q86VQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LCA5Q86VQ0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LCA5Q86VQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LCA5Q86VQ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LCA5Q86VQ0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LCA5Q86VQ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms