Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC51AQ86UW1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SLC51AQ86UW1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC51AQ86UW1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SLC51AQ86UW1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SLC51AQ86UW1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SLC51AQ86UW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SLC51AQ86UW1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SLC51AQ86UW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SLC51AQ86UW1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SLC51AQ86UW1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SLC51AQ86UW1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms